近期,植科系张微微老师承担的我校首个上海自然科学基金项目“黄瓜果刺大小基因(ss)的精细定位与候选基因分离(15ZR1429800)”,通过上海市科学技术委员会审查,准予结题。
该项目通过构建高密度遗传连锁图谱对黄瓜果刺大小性状的初步定位,进一步构建分离群体结合BSA法对黄瓜果刺大小基因进行定位,通过大群体完成精细定位,并进行候选基因的分离,这些工作的开展为果刺大小性状形成的分子机制的揭示奠定了重要的基础,也为黄瓜分子标记辅助育种及分子设计育种提供理论依据;同时与目标性状紧密连锁分子标记的获得及相应分子标记辅助选择系统的建立,加快了黄瓜品质育种进程,显著缩短了育种周期,将为黄瓜品质育种带来更好的经济效益。

果刺大小性状是黄瓜重要品质性状之一,影响着黄瓜的经济价值,同时无果瘤、果刺小的黄瓜污染少,清洗方便,食用卫生,是无公害蔬菜的理想品种,因此对黄瓜果刺大小基(SS/ss, small spine)的研究具有很现实意义。以往对于果刺大小性状研究仅限于遗传规律分析方面,国内外尚无对黄瓜果刺大小基因进行分子标记定位报道。
张微微老师以此为切点开展了果刺大小基因精细定位及候选基因分离研究。利用黄瓜自交系品种进行果刺大小性状形态解剖学观察;BSA法结合SSR和新开发Indel标记筛选果刺大小基因紧密连锁标记,最终将目标基因精细定位在物理距离189kb区域;黄瓜全基因组及100份核心种质的重基因组测序平台,预测21个候选基因,进一步分析锁定2个候选基因;并基于获得与果刺大小基因紧密连锁分子标记SE1对32份不同黄瓜自交系进行MAS验证,建立分子辅助选择育种体系,研究开展为果刺大小性状调控机制的阐明、加速育种进程工作奠定了基础。成果以“Identification and fine mapping of molecular markers closely linked to fruit spines size ss gene in cucumber (Cucumis sativus L.)”为题发表于SCI期刊Euphytica上(Euphytica, 2018, 214:213, https://doi.org/10.1007/s10681-018-2251-y)。




论文第一作者为张微微老师,植科系俞平高主任和交大潘俊松教授为项目和论文提供了技术指导和重要实施建议,俞平高和潘俊松是共同通讯作者,上海农林职业技术学院是通讯作者单位。
此外,张微微老师基于黄瓜高密度遗传图谱,对黄瓜果实相关性状QTL位点进行检测,论文“黄瓜加密图谱构建及果实性状QTLs定位”发表在“分子植物育种, 2016, 14 (6): 1538-1547”[核心];对黄瓜花相关性状QTL位点进行检测,论文“利用黄瓜加密图谱定位花相关性状QTLs”发表在“基因组学与应用生物学, 2016, 35(6): 1530-1538.”[核心];以及对侧枝相关性状QTL位点进行检测,论文“黄瓜RIL群体侧枝相关性状QTL定位”发表在“江苏农业学报, 2017, 33(1):174-180.”[核心]。这些数据为以后黄瓜果实、花、侧枝等相关性状的分子研究及选育工作提供可靠的依据。



张微微,博士,高级工程师。上海交通大学生物医学工程(生物技术)专业工学博士。2014年进入上海农林职业技术学院植物科学技术系任专任教师,园艺技术专业教研室主任,主要从事植物遗传育种领域相关研究,发表SCI期刊文章9篇(PLOS One,Theoretical and Applied Genetics,The Plant Journal,Molecular Breeding,Euphytica),核心期刊10余篇(园艺学报、江苏农业学报、分子植物育种、植物分类与资源学报等);主持参与完成“国家自然科学基金”、“上海市自然科学基金”、“科技兴农”及“上海市教委优青”等项目8项,其中主持“上海市教委(ZZNL15001)”“上海市自然科学基金(15ZR1429800)”及校内课题(KY1-0000-15-01)各1项,2016年作为第5完成人获国家教育部“技术发明一等奖“(证书号:2015-126)。作为专任教师,曾获2018年第三届上海高校青年教师教学竞赛“三等奖”、2017年上海市高等职业院校教师说课大赛(决赛)“一等奖”、2017年上海市高等职业院校教师说课大赛(其他类专业)“一等奖”、2017年“尚农杯”教师教学技能竞赛 “二等奖”和“最佳风采奖”、2016-2017学年上海农林职业技术学院(上海市农业学校)“优秀教学质量奖”及2015-2016学年上海农林职业技术学院(上海市农业学校)“优秀教学质量奖” 。